上海市杨浦区爱国卫生运动委员会办公室设在上海市杨浦区卫生局。根据区委、区政府《关于印发<上海市杨浦区人民政府机构改革方案>的通知》（杨委发[2009]11号）精神，设立上海市杨浦区卫生局，为主管本区卫生工作的区政府工作部门。