黎遇航出生于一个贫寒家庭，黎遇航出生7个月丧母，由祖母抚养，5岁时祖母过世，其父黎洪春原是名瓦工，一次烧石灰时石灰爆裂致使双目失明，因生活窘迫，入茅山元符万宁宫西斋道院拜道教茅山上清派耿云清为师。随父在茅山元符万宁宫出家，取道名顺吉，勤奋好学的黎遇航得名师授学，很快成为道观之佼佼者，十八九岁时，就带了徒弟。抗日战争时期，黎遇航和茅山宫观不少道士及当地群众积极投入抗日洪流，为部队做向导，送情报。黎遇航先当新四军粮食保管员，后作情报站站长。